Llywodraeth Cymru sy’n gosod y polisïau a’r fframwaith deddfwriaethol ar gyfer rheoli a diogelu amgylchedd morol Cymru. Mae ei chysylltiad â’r Gronfa yn helpu i sicrhau bod Cronfa MARINE Cymru yn cyd-fynd â’r blaenoriaethau cenedlaethol ar gyfer cynllunio morol, adferiad natur a defnyddio moroedd Cymru mewn modd cynaliadwy.